Zgodnie z art. 10 ust. 10 Ustawy z dnia 19 października 1991 r. o gospodarowaniu nieruchomościami rolnymi Skarbu Państwa, stały nadzór we wszystkich dziedzinach działalności Agencji wykonuje Rada Nadzorcza.

Zdzisław Gajewski (Przewodniczący), Michał Wójciak, Janusz Bilski - przedstawiciele Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi; Marek Idzkiewicz, Dariusz Bliźniak, Stanisława Okularczyk - przedstawiciele Ministra Skarbu Państwa; Jadwiga Nowakowska – przedstawiciel Ministra Finansów; Andrzej Kania – przedstawiciel Ministra Gospodarki; Leszek Grala – przedstawiciel Krajowej Rady Izb Rolniczych; Krzysztof Banasiak – przedstawiciel Krajowego Związku Rolników, Kółek i Organizacji Rolniczych; Krzysztof Kokoszkiewicz - przedstawiciel Krajowego Związku Rewizyjnego Rolniczych Spółdzielni Produkcyjnych; Ryszard Kasperski - przedstawiciel Niezależnego Samorządnego Związku Zawodowego Rolników Indywidualnych "Solidarność".